Les scientifiques ont réussi à séquencer le génome du chien, une réalisation qui pourrait mener à une meilleure santé pour les humains et les chiens, et une équipe internationale de chercheurs a publié leur analyse détaillée dans la revue Nature.

Il est professeur de biologie au MIT et de biologie des systèmes à la Harvard Medical School, ainsi que membre du Whitehead Institute for Biomedical Research.

L'incroyable diversité physique et comportementale des chiens - du Chihuahuas au Grand Danois - est codée dans leurs génomes, ce qui peut nous aider à comprendre le développement embryonnaire, la neurobiologie, les maladies humaines et la base de l'évolution ", note le Dr Lander.

Outil puissant

Lorsqu'on le compare avec les génomes de l'homme et d'autres organismes importants, le génome du chien fournit un outil puissant pour identifier les facteurs génétiques qui contribuent à la santé humaine et la maladie", dit Francis S. Collins, MD, PhD, directeur de l'Institut national de recherche sur le génome humain (NHGRI), qui a soutenu la recherche.

Ce jalon est particulièrement gratifiant parce qu'il bénéficiera aussi directement aux efforts des chercheurs vétérinaires pour mieux comprendre et traiter les maladies qui affligent nos fidèles compagnons canins ", ajoute le Dr Collins.

L'homme a domestiqué le chien, Canis familiaris, de loups gris il y a 100 000 ans, et grâce à un élevage sélectif au cours des derniers siècles, les races de chiens modernes présentent un modèle de diversité : du Chihuahuas de six livres au Grand Danois de 120 livres, du Jack Russell Terrier à haute énergie au basset doux, et du chien de berger Shetland avec ses instincts de troupeau jusqu'au chien de berger des Shetland avec ses instincts de troupeau.

De telles pratiques d'élevage préservent les caractères préférés d'une génération à l'autre, mais elles prédisposent aussi de nombreuses races de chiens à des troubles génétiques, y compris les maladies cardiaques, le cancer, la cécité, la cataracte, l'épilepsie, la dysplasie de la hanche et la surdité.

Le groupe de recherche a constaté que bien que différentes races présentent une diversité physique étonnante, elles partagent souvent de larges segments de leur ADN, ce qui reflète probablement leur origine commune récente, ce qui fait que les outils génétiques en cours de développement au Broad Institute et à l'INDH pour n'importe quelle race de chiens sont susceptibles d'être utiles dans les expériences génétiques dans presque toutes les races.

Arbre évolutif

Alors que les chiens occupent une place particulière dans le cur de l'homme, ils sont également assis à un point clé de l'arbre évolutionnaire, par rapport à l'homme : on savait déjà que les humains partagent plus leur ADN ancestral avec les chiens qu'avec les souris ; la disponibilité de la séquence du génome canin a permis aux chercheurs de décrire un ensemble commun d'éléments génétiques - représentant environ 5 % du génome humain - qui sont conservés de préférence chez l'homme, le chien et la souris.

Les études futures de ces grappes pourraient donner aux scientifiques les connaissances critiques nécessaires pour élucider le fonctionnement des génomes.

Elaine A. Ostrander, PhD, chef de la Direction de la génétique du cancer de la NHGRI, est coauteur du document Nature, avec Heidi G. Parker et Nate B. Sutter, boursiers de recherche postdoctorale, et le Dr Ostrander est l'auteur principal du livre blanc qui expose les raisons biomédicales du séquençage du génome canin.

Le laboratoire du Dr Ostrander cartographie les gènes responsables de la susceptibilité au cancer - y compris les cancers du sein et de la prostate - chez les chiens et les humains.

L'utilisation de la séquence du génome du chien en combinaison avec la séquence du génome humain aidera les chercheurs à réduire leur recherche de nombreux autres facteurs génétiques à l'origine du cancer et d'autres maladies majeures.

Boussole génétique

Il y a plus de deux ans, Kerstin Lindblad-Toh, PhD, codirecteur du programme de séquençage et d'analyse du génome au Broad Institute, et ses collègues se sont lancés dans un projet en deux parties pour assembler une carte complète du génome caniche.

Tout d'abord, ils ont acquis une séquence d'ADN de haute qualité couvrant près de 99 % du génome canin d'une boxeuse nommée Tasha, choisie comme représentante du chien de race pure moyenne pour produire ce qui est devenu une séquence de référence pour la communauté chien-génome.

Utilisant l'information séquentielle comme une boussole génétique, ils ont navigué dans les génomes de 10 races canines différentes et d'autres espèces canines apparentées, y compris le loup gris et le coyote.

Les chercheurs ont identifié environ 2,5 millions de polymorphismes nucléotidiques simples, ou SNP, parsemés dans le génome du chien, qui sont des variations du code ADN, dont certaines contribuent à des maladies ou à la santé globale du chien.

Ces efforts ont révélé que les races individuelles ont maintenu une grande variabilité génétique, malgré leur longue histoire d'élevage restrictif.

En termes pratiques, cela signifie que les efforts futurs pour localiser les gènes de la maladie chez le chien peuvent avoir une portée beaucoup plus étroite que les études humaines comparables, nécessitant un plus petit nombre de marqueurs génétiques et d'échantillons d'ADN prélevés dans le sang ou les joues de quelques centaines de chiens seulement.





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